Les scientifiques ont déterminé comment les bactéries inoffensives de l’intestin E. coli chez les poulets peuvent ramasser les gènes nécessaires pour évoluer et causer des infections chez les volailles et les personnes.

La colibacillose causée par e. coli pathogène aviaire (APEC) est l’infection la plus courante chez les poulets élevés pour de la viande ou des œufs. Il est mortel dans jusqu’à 20 pour cent des cas et provoque des pertes de plusieurs millions de livres dans l’industrie avicole. D’autres problèmes incluent l’augmentation de la résistance aux antibiotiques et le risque d’infections humaines, selon le rapport de recherche.

Les scientifiques ont séquencé et analysé l’ensemble du génome de 568 bactéries E. coli présentes chez des poulets sains et infectés élevés dans des fermes avicoles commerciales afin de mieux comprendre pourquoi et comment les insectes inoffensifs peuvent devenir mortels. Les résultats ont été publiés dans la revue Nature Communications.

Ils ont constaté qu’il n’y avait pas un seul gène responsable du passage de l’inoffensif à l’agent pathogène, mais il pourrait être causé par plusieurs combinaisons d’un groupe diversifié de gènes.

De inoffensif à dangereux
Les résultats indiquent que toutes les bactéries dans les intestins de poulet ont le potentiel de ramasser les gènes dont elles ont besoin pour se transformer en une infection dangereuse, par le biais d’un processus appelé transfert horizontal de gènes. Cela permet aux bactéries d’acquérir du nouveau matériel génétique auprès d’autres bactéries à proximité.

Le professeur Sam Sheppard, qui a dirigé l’étude, a déclaré qu’on pensait auparavant que E. coli était devenu pathogène en acquérant des gènes spécifiques à partir d’autres bogues, souvent dans des éléments mobiles appelés plasmides.

« Mais notre étude a comparé les génomes d’E. coli pathogène et inoffensif chez les poulets et a constaté qu’ils peuvent mal tourner simplement en ramassant des gènes de leur environnement. Les bactéries font cela tout le temps à l’intérieur de l’intestin du poulet, mais la plupart du temps les gènes reclacés sont nuisibles aux bactéries de sorte qu’il devient une impasse évolutionnaire », at-il signalé.

Les isolats de volaille de l’ensemble de données se sont regroupés dans six des huit phylogroupes connus d’E. coli. Au total, 211 isolats, soit 39 p. 100, appartenaient à la séquence de type 117, qui, avec des isolats dans les phylogroupes B2, B1 et A, regroupait 93 p. 100 des isolats.

Sheppard, de l’Université de Bath, a déclaré qu’il y a 26 milliards de poulets dans le monde.

« Cela augmente la probabilité que des bactéries captent des gènes qui pourraient aider les bactéries à survivre et à devenir infectieuses, ou même à sauter des espèces pour infecter les humains. Nous avons été surpris de constater que ce n’est pas seulement une seule souche qui cause l’APEC, mais toute souche peut potentiellement acquérir la combinaison monstre de gènes nécessaires pour tourner mal », at-il écrit.

Les souches ayant le potentiel de devenir pathogènes pourraient être identifiées en utilisant le séquençage du génome entier et des tests PCR rapides pour sonder des gènes spécifiques qui pourraient mener à une infection de l’APEC. L’identification précoce des agents pathogènes a le potentiel d’améliorer le bien-être du bétail et de réduire les pertes économiques dues à la maladie.

« Nous avons identifié une vingtaine de gènes communs dans les insectes pathogènes et si nous pouvons rechercher ces gènes clés dans un troupeau d’oiseaux, cela aiderait les agriculteurs à cibler ces porteurs avant qu’ils ne causent un problème », a déclaré M. Sheppard.

Analyse STEC
Entre-temps, une autre étude a révélé que les souches E. coli (STEC) productrices de toxines Shiga qui abritent des gènes de virulence pathogènes extraintestinaux associés à E. coli (ExPEC) peuvent inclure plusieurs sérotypes.

Les chercheurs ont caractérisé 53 souches de STEC présentant des traits de virulence associés à l’ExPEC isolés de patients infectés et d’aliments contaminés en Italie et aux Pays-Bas de 2000 à 2019.

Sur les 53 souches, 30 avaient été isolées en Italie, principalement chez des patients atteints du syndrome hémolytique urémique (SHU) ou d’une colite hémorragique sévère. Le SHU est associé à de graves infections à E. coli. Deux souches proviennent de produits d’origine bovine en Italie. Les 23 souches de STEC restantes avaient été isolées de patients aux Pays-Bas, dont certaines avaient la diarrhée ou la diarrhée sanglante ou avaient été hospitalisées.

Les souches STEC avec ces gènes appartenaient à 10 sérotypes différents, avec une prévalence élevée d’O80:H2. Cinq autres sérotypes ont été trouvés à partir de sources antérieures.

Ces souches ont circulé en Europe et causé de graves infections humaines depuis 2001 ou avant, selon l’étude publiée dans la revue Emerging Infectious Diseases.

(Pour vous inscrire à un abonnement gratuit à Soya75, cliquez ici.)

LAISSER UNE RÉPONSE

Vous avez entré une adresse e-mail incorrecte!
Veuillez entrer votre nom ici