Les niveaux d’E. coli résistant aux antimicrobiens (AMR) dans le bœuf et le porc frais sont encore faibles, selon une enquête publiée par l’Agence des normes alimentaires (FSA).
L’étude, qui s’est menée entre janvier et décembre 2019, portait sur le bœuf et le porc. Au total, 315 échantillons de bœuf et 313 échantillons de porc ont été prélevés et testés au détail au Royaume-Uni.
En raison d’un problème technique avec l’agar sélectif (milieu de croissance de la culture) affectant certains échantillons testés en décembre, il a été décidé d’exclure tous les échantillons de viande au cours de ce mois de l’analyse.
L’utilisation d’antibiotiques est importante dans le traitement des infections et la prévention des maladies chez les animaux et les humains. Toutefois, la surutilisation ou l’utilisation abusive d’antimicrobiens dans l’élevage et les soins de santé est liée à l’émergence et à la propagation de micro-organismes qui leur résistent, rendant le traitement inefficace et présentant un risque pour la santé publique, selon les responsables de la santé et les chercheurs.
Faibles niveaux détectés
Des exigences obligatoires sont fixées dans la réglementation européenne pour que les États membres signalent les données de l’AMR pour Salmonella spp., Campylobacter jejuni, l’indicateur commensal E. coli, ampc et bêtalactamase à spectre étendu (ESBL) E. coli et carbapenemase produisant E. coli.
Moins de 1 p. 100 des échantillons avaient E. coli et les types d’AMR étaient surveillés. Un seul des 289 échantillons de bœuf et trois des 285 échantillons de porc étaient positifs pour E. coli, producteur d’AmpC ou d’ESBL. Aucun des dénombrements d’E. coli dans le bœuf et le porc n’était supérieur à la limite de détection de 100 bactéries par gramme de viande sur les deux agars utilisés.
Aucun E. coli résistant aux carbapénèmes et résistant à la colistine n’a été trouvé dans aucun échantillon. Ceux-ci sont considérés comme des antibiotiques d’une importance critique. Aucun des isolats n’était résistant au chloramphénicol, à la ciprofloxacine, à la gentamycine, à l’acide nalidixique, à la temocilline ou à la tigecycline.
L’Agence de la santé animale et végétale (APHA) a collaboré avec Hallmark Veterinary Compliance Services, qui a organisé l’échantillonnage, la collecte et l’affichage d’échantillons de viande au détail à l’APHA.
Les échantillons de viande provenaient principalement du Royaume-Uni, mais aussi d’Argentine, de Belgique, du Danemark, de l’UE (pays non déclaré), de France, d’Allemagne, d’Irlande, des Pays-Bas et d’Espagne. Le deuxième plus grand nombre d’échantillons de bœuf provenait d’Irlande, tandis que le deuxième plus grand nombre d’échantillons de porc provenaient d’Allemagne.
Dans l’ensemble du Royaume-Uni, les données montrent que les niveaux d’AmpC-/ESBL-phénotype E. coli dans le bœuf et le porc sont restés à un faible niveau stable en 2015, 2017 et 2019. Les résultats se comparent favorablement aux résultats publiés par l’Autorité européenne de sécurité des aliments d’autres pays qui ont mené des enquêtes de suivi de l’UE en 2015 et 2017.
Recherche pour combler l’écart de données probantes
Paul Cook, directeur scientifique de la FSA en évaluation des risques microbiologiques, a déclaré que les résultats étaient rassurants.
« Nous poursuivrons notre travail pour combler le manque de preuves du rôle que jouent les aliments dans la résistance aux antimicrobiens. Le risque de contracter des infections liées à la DMR par la consommation et la manipulation de viande contaminée est très faible, à mesure que vous suivez de bonnes pratiques d’hygiène et de cuisson », a-t-il déclaré.
La FSA a lancé un appel d’offres pour une enquête sur Salmonella, E. coli et AMR dans des produits de volaille congelés, mi-cuits panés ou battus lors d’une vente au détail au Royaume-Uni. La date limite est le 11 décembre 2020.
Un projet de recherche lancé en juillet de cette année tente de créer un ensemble de modèles pour l’évaluation des risques de la DME dans la chaîne d’approvisionnement du poulet et de la laitue. Les travaux d’Ausvet Europe permettront à la FSA de produire des évaluations plus efficaces et reproductibles des risques amr dans les aliments. Son achèvement est prévu pour janvier 2022.
Un autre projet consiste à échantillonner 165 biofilms provenant d’installations secondaires de transformation de la viande. Les données serviront à estimer la contribution des biofilms dans les usines de transformation de la viande au fardeau de la DMA. Ce travail est effectué par Fera Science jusqu’en juin 2022.
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