Les chercheurs ont mis au point un système d’accès restreint conçu pour aider les personnes impliquées dans l’enquête sur les éclosions de maladies d’origine alimentaire.
Le catalogue de données partagé et consultable des flambées précédentes s’appelle le Global Foodsource Identifier (GFI).
Une fois qu’il sera utilisé par la communauté internationale de la salubrité des aliments, les chercheurs espèrent que GFI aidera lors des enquêtes sur les flambées et appuiera les stratégies d’échantillonnage fondées sur les risques pendant les tâches de traçabilité. Il peut également aider à identifier les nouvelles menaces pour la salubrité des aliments.
La plate-forme de réseautage est destinée à accueillir une société mondiale en ligne impliquée dans l’enquête sur les flambées, qui peut communiquer et échanger des données non confidentielles d’une manière harmonisée et comparable.
Attributs des dossiers d’éclosion
Une fois qu’une souche épidémique est identifiée et dactylographiée, le catalogue de données peut être recherché pour trouver des flambées antérieures causées par le même agent causal ou un agent causal similaire, pour voir si un certain pays a été touché, ou si un milieu commun ou une source de nourriture a été impliqué.
Chaque dossier contient des renseignements sur le type d’agent causal, la source alimentaire identifiée et l’information épidémiologique.
Il est hébergé dans un environnement de recherche virtuel (ERV), qui permet l’échange de documents, la communication, la visualisation de données et l’analyse entre les membres.
Selon l’étude publiée dans la revue Food Control, les scientifiques ont sélectionné 46 attributs caractérisant les dossiers d’éclosion à inclure dans le catalogue, sous quatre catégories : agent causal, données épidémiologiques, source alimentaire ou détails du rapport.
Chaque enregistrement est associé à des balises pour l’année d’éclosion, à l’agent causal, au pays et à la source de nourriture (type, sous-type et variété), et une URL unique est générée. Des informations de gestion sont également ajoutées, y compris l’auteur, le maintenant, la version, l’état, la date de création et la mise à jour la plus récente. La visibilité record peut être définie comme étant restreinte, de sorte que seuls les membres de l’ERV verront l’entrée complète ou le public.
La politique actuelle d’adhésion de GFI est restreinte, de sorte que les candidats doivent demander aux gestionnaires de l’ERV de se joindre à l’équipe. L’adhésion est gérée par l’Université technique du Danemark.
Alternatives et réseau de construction
Lors du lancement public de GFI, le catalogue de données a été rempli de dossiers de 102 flambées au Danemark de 2005 à 2016, couvrant les agents pathogènes les plus fréquents et une gamme de méthodes de dactylographie. Cela a été fait pour illustrer le potentiel de GFI pour les nouveaux membres et les encourager à contribuer leurs propres dossiers.
Certains pays ont des bases de données nationales avec des informations sur les flambées d’origine alimentaire, d’origine hydrique ou infectieuse, mais elles sont structurées de différentes manières et ne sont pas interconnectées, ont déclaré les scientifiques.
Il existe également plusieurs bases de données internationales existantes telles que le Système européen de surveillance (TESSy), NoroNet par RIVM, PulseNet International, le Global Microbial Identifier ou GenomeTrakr.
Cependant, la plupart d’entre eux sont ciblés sur un agent pathogène spécifique ou une méthode de dactylographie, et beaucoup ne sont pleinement disponibles pour un certain nombre de personnes ou ont une accessibilité limitée pour le public, ont déclaré les chercheurs.
Les utilisateurs des pays où la communication internationale à l’échelle du réseau est déjà effectuée au cours des enquêtes sur les flambées peuvent montrer plus de résistance à rejoindre GFI, estimant qu’il n’offre aucune valeur ajoutée, ont déclaré les scientifiques. Un financement assitional sera également nécessaire pour l’entretien et l’adaptation de l’ERV aux besoins de la communauté, selon l’étude.
L’idée est née d’un projet de recherche européen appelé COMPARE qui s’est mené de 2014 à 2019 et a impliqué 30 participants avec l’Université technique du Danemark à la tête des travaux. L’objectif était d’améliorer l’identification et l’atténuation des maladies infectieuses émergentes et des flambées de maladies d’origine alimentaire.
Les développements futurs de GFI peuvent inclure des conversations privées et des conférences téléphoniques entre les membres.
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