Le séquençage pangénomique est une technique de laboratoire qui consiste à déterminer la séquence complète d’ADN du génome d’un organisme. « Le concept a été lancé dans les années 1970, mais ce n’est qu’avec le développement des technologies de séquençage à haut débit au début des années 2000 que la technique est devenue peu coûteuse et suffisamment rapide pour être pratique et largement utilisée. »Gurry a expliqué.

En 2018, la Commission européenne a lancé le projet EU 1 Million Genomes, une initiative ambitieuse visant à créer une plateforme de données partagée d’un million de génomes humains séquencés. Les technologies de séquençage du génome entier ont depuis révolutionné la sécurité alimentaire, permettant aux fabricants de retracer avec précision les chaînes d’introduction et de transmission des agents pathogènes et des organismes de détérioration dans la production alimentaire.

« Lorsqu’un agent pathogène ou un organisme de détérioration est détecté dans un échantillon d’aliment, son génome entier peut être séquencé et comparé à des bases de données de génomes d’agents pathogènes connus et d’organismes de détérioration pour déterminer la souche et le sous-type exacts. », a déclaré M. Gurry. « En comparant les génomes de différents échantillons, les chercheurs peuvent identifier des marqueurs génétiques et des mutations partagés, ce qui leur permet de suivre la propagation de l’organisme et d’identifier la source de contamination. »

Le séquençage pangénomique peut également être utilisé pour détecter les éclosions de maladies d’origine alimentaire, en comparant les génomes d’agents pathogènes isolés chez différentes personnes qui sont tombées malades. En plus de retracer les chaînes de transmission des agents pathogènes et des organismes de détérioration dans la production alimentaire, le séquençage pangénomique peut également être utilisé pour surveiller le microbiome des installations de production alimentaire, identifier les sources potentielles de contamination et aider les fabricants à prendre des mesures proactives pour prévenir la propagation des organismes nuisibles.

Le potentiel de ces technologies de pointe s’étend au-delà de la sécurité alimentaire

Cependant, le potentiel de ces technologies de pointe dans le secteur de la fabrication de produits alimentaires s’étend encore plus loin, nous a dit M. Gurry. Des scientifiques pionniers et des fabricants de produits alimentaires ont récemment commencé à appliquer des techniques sophistiquées de séquençage du génome pour concevoir des compléments alimentaires qui ont de puissants avantages pour la santé. Le séquençage du génome entier peut être utilisé pour développer et fabriquer des aliments ayant des saveurs particulières ou de puissants avantages pour la santé en permettant aux scientifiques d’identifier et de caractériser les micro-organismes qui produisent des composés bénéfiques. « Ces informations peuvent ensuite être utilisées pour développer des produits alimentaires et des suppléments qui optimisent la production des composés par les micro-organismes. » dire. « Les connaissances et les connaissances obtenues à partir d’un processus de cartographie génétique ont permis le développement de compléments alimentaires génériques et personnalisés conçus pour améliorer des résultats de santé spécifiques. »

Le Dr Gurry se décrit comme un biologiste computationnel et des systèmes intéressé par les applications translationnelles du microbiome intestinal humain qui a développé une combinaison de méthodes expérimentales et informatiques pour concevoir les capacités de fermentation du microbiote d’un patient afin d’optimiser les résultats pour la santé. Ces connaissances ont ensuite été intégrées au myote de la start-up de technologie de la santé.

L’innovateur en santé intestinale myota a adopté des recherches révolutionnaires sur le fonctionnement des bactéries intestinales pour lancer un kit d’autotest breveté sur le microbiome.

Test de santé intestinale pour « démystifier votre microbiome »

Le séquençage du génome d’un individu permet aux scientifiques de détecter les variations génétiques qui peuvent avoir un impact sur le métabolisme des nutriments ou d’autres facteurs liés à la santé, a poursuivi le cofondateur. Ces connaissances peuvent être utilisées pour créer des produits alimentaires et des formules de suppléments adaptés à des besoins nutritionnels spécifiques ou à des problèmes de santé. Myota, par exemple, au milieu de recherches approfondies qui indiquent maintenant de multiples liens entre un microbiome intestinal sain et la capacité du corps à prévenir et à inverser les maladies chroniques (y compris l’obésité, le diabète, la MPOC, l’arthrite et les MII), fabrique des mélanges de fibres sur mesure qui améliorent l’intestin et la santé globale d’une personne en aidant votre microbiome intestinal à produire plus d’acides gras à chaîne courte (AGCC).

La start-up basée au Royaume-Uni a également utilisé ce qu’elle décrit comme des recherches révolutionnaires sur le fonctionnement des bactéries intestinales pour développer un kit d’autotest breveté sur le microbiome. Les utilisateurs du paquet de 300 £ ont un aperçu inégalé de la composition unique et de la santé de leurs bactéries intestinales. La société affirme que pour la toute première fois, les résultats des tests révéleront également les types de fibres préférés par le microbiome du sujet, fournissant une feuille de route pour améliorer sa santé et son activité.

Après la commande en ligne et la livraison à domicile, les utilisateurs sont fournis avec un kit et des instructions pour prélever un petit échantillon de selles à partir d’un morceau de papier toilette. L’échantillon est renvoyé dans un laboratoire, où les trillions de bactéries intestinales sont séquencés et un rapport détaillé généré

Les utilisateurs reçoivent un rapport personnalisé sur le microbiome intestinal, comprenant des informations sur la composition unique, la diversité et la capacité de fermentation des fibres de leur microbiome, et comment cela se compare à la moyenne de leur groupe d’âge et de leur sexe.

« Cette nouvelle trousse de diagnostic offre à quiconque la possibilité de commencer son parcours de santé intestinale. À moins de savoir quels types de fibres votre propre microbiome est spécialisé pour fermenter, il est impossible de savoir comment adapter votre alimentation pour une santé optimisée., a déclaré M. Gurry. « Cette trousse, associée au soutien de notre diététiste interne, élimine les conjectures. »

Le processus semble alambiqué. Pourtant, les tests de microbiome à domicile sont en passe de devenir l’une des tendances sanitaires à la croissance la plus rapide de 2023, affirme la start-up. Par exemple, la start-up Daye a récemment levé 10 millions de dollars auprès d’investisseurs pour lancer la première plateforme de dépistage du microbiome vaginal à domicile à base de tampons au monde, et Sequential Skin a récemment lancé son kit de test du microbiome cutané.

« Comme les progrès des technologies de séquençage permettent de sonder plus profondément le matériel génétique présent dans l’intestin d’un individu de manière de plus en plus rentable, il devient possible d’adapter les choix alimentaires à l’individu. »a poursuivi M. Gurry.

Par exemple, les fibres prébiotiques sont un élément crucial d’une alimentation humaine saine, car elles sont fermentées par le microbiome intestinal pour produire des AGCC qui sont essentiels au maintien de la santé et à la prévention de plusieurs maladies chroniques, y compris le diabète de type 2. sont prouvés pour aider à réduire le risque de plusieurs maladies chroniques, y compris l’athérosclérose et le diabète

Cependant, étant donné que différentes bactéries intestinales préfèrent différents types de fibres prébiotiques, la plupart des gens ne consomment pas suffisamment de la « bonne » fibre prébiotique qui convient le mieux à leur santé. « Pour prédire avec précision l’information présente dans un échantillon de microbiome, il est nécessaire de comprendre les génomes de chaque bactérie du microbiome, y compris la fonction de chacun de leurs gènes. Avec cette compréhension, des gènes spécifiques responsables de la production d’AGCC et de la dégradation des prébiotiques peuvent être identifiés.a observé le PDG.

« En formulant un mélange de suppléments qui fournit tous les types de fibres prébiotiques requis par le microbiome d’un individu, il est possible d’optimiser la production d’AGCC pour chaque personne et d’offrir les avantages mentaux et physiques associés. Cela élimine les conjectures de la santé intestinale et fournit une solution personnalisée pour une santé intestinale optimale. »

Des allégations pleinement étayées peuvent guérir le « lavage de la santé »

Dans un marché saturé d’aliments fonctionnels, pendant ce temps, les produits sous-tendus par la biotechnologie se différencient par leurs allégations d’amélioration de la santé pleinement prouvées, estime le scientifique.

Les consommateurs sont fatigués du « lavage de santé » dans le marketing des produits et des « allégations exagérées et sous-étayées qui ne produisent pas d’avantages notables ». Le moment est donc venu de développer des produits à l’aide des connaissances du séquençage du génome, a-t-il affirmé. « C’est une occasion de différenciation; Les produits développés à l’aide des connaissances du séquençage du génome bénéficient d’une multitude de recherches cliniques et de preuves établies à l’appui de leur efficacité.

« Au fur et à mesure que nous en apprenons davantage sur la relation entre l’alimentation, le bien-être, la longévité et les maladies chroniques, les preuves de bon nombre de ces produits deviendront encore plus convaincantes pour les consommateurs et les fabricants. »

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