Le nombre d’infections par des virus gastro-intestinaux a chuté mais les rapports d’agents pathogènes bactériens n’ont pas beaucoup diminué en Corée du Sud pendant la pandémie de coronavirus, selon une étude.

Ces virus sont principalement causés par la voie fécale-orale et nécessitent un contact direct entre les personnes, tandis que les agents pathogènes bactériens ont la transmission alimentaire comme principale cause d’infection.

Les chercheurs ont examiné comment l’incidence des infections gastro-intestinales a changé depuis le début de la COVID-19 à l’aide des données publiées par la Korea Disease Control and Prevention Agency (KDCA) de mars 2018 à février 2021. Les résultats ont été publiés dans la revue korean Academy of Medical Sciences.

Déclin du virus
À partir de mars 2020, lorsque la distanciation sociale et l’hygiène personnelle ont été fortement mises en avant, l’ampleur de l’infection par chaque virus a considérablement diminué. Les taux de réduction par rapport aux moyennes des deux dernières années étaient de 31,9 pour cent pour l’ensemble des virus, de 40,2 pour cent pour les norovirus, de sept pour cent pour l’astrovirus et de 12 pour cent. 2 pour cent pour le sapovirus.

De mars 2018 à février 2019, il y a eu 4 986 cas de norovirus, comparativement à 6 174 en mars 2019 à février 2020 et à 2 244 en mars 2020 à février 2021.

Des mesures telles que le lavage des mains ou le port d’un masque peuvent avoir mené au déclin. Cependant, les virus gastro-intestinaux n’ont pas montré de diminutions spectaculaires comme l’ont fait les virus respiratoires, ce qui suggère le rôle d’une infection d’origine alimentaire pour les virus gastro-intestinaux.

L’une des limites de l’étude est que les données ne proviennent pas de tous les patients à l’échelle nationale et qu’il est possible que d’autres personnes n’aient pas visité l’hôpital ou n’aient pas pu être traitées en raison de la pandémie.

Infections bactériennes stables
Les taux d’infection de Campylobacter et de Clostridium perfringens ont augmenté au cours de certaines périodes par rapport à la moyenne des deux dernières années. L’incidence de Salmonella, de Staphylococcus aureus ou d’E. coli entéropathogène non typhopathogène a diminué, mais pas de manière significative par rapport aux deux années précédentes.

Une éclosion d’infection à E. coli entérohématragique (ECEH) a été signalée en juin 2020 en Corée. La CEES est passée d’une moyenne de 129 cas par année de mars 2016 à février 2020 à 318 infections de mars 2020 à février 2021 en raison de l’importante éclosion de juin à août.

De mars 2018 à février 2021, l’infection à Campylobacter était la plus fréquente, suivie de Clostridium perfringens et de Salmonella non typhoïde. Environ 100 cas de Staphylococcus aureus et d’EPEC se sont produits chaque année.

De mars 2018 à février 2019, 2 433 infections à Clostridium perfringens ont été enregistrées, 3 749 de 2019 à 2020 et 3 134 de 2020 à 2021. Les totaux pour Campylobacter étaient de 2 693, 3 479 et 3 329 ainsi que de 2 386, 2 684 et 1 851 pour Salmonella non typhoïde.

De mars 2018 à février 2019, 112 cas de Staphylococcus aureus ont été signalés, 156 l’année suivante et 75 de mars 2020 à février 2021. Les totaux pour l’EPEC étaient de 132, 139 et 106.

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