Une étude de chercheurs de l’Université de Géorgie, publiée dans Agents antimicrobiens et chimiothérapie, a montré que 60 % des échantillons de matières fécales de bovins contenaient plusieurs souches de salmonelles que les méthodes d’analyse traditionnelles ne respectaient pas. Elle a également révélé qu’environ un échantillon sur 10 a donné des résultats positifs pour Salmonella Reading, un sérotype de Salmonella résistant aux médicaments.
L’étude souligne l’importance de la surveillance de la résistance aux antimicrobiens (RAM) dans diverses populations de bactéries.
La technologie développée par la chercheuse de l’UGA Nikki Shariat, professeure adjointe de santé de la population au Collège de médecine vétérinaire en 2015, CRISPR-SeroSeq, permet aux chercheurs d’analyser tous les types de salmonelles présents dans un échantillon donné. Les méthodes précédemment utilisées n’ont examiné qu’une ou deux colonies de bactéries, ce qui laissait la possibilité de passer à côté de souches de salmonelles.
La technologie de Shariat identifie les signatures moléculaires dans l’ADN de Salmonella dans une partie spécialisée appelée les régions CRISPR. Cette technologie aide également les chercheurs à identifier les souches de la bactérie les plus abondantes.
Salmonella Reading peut causer une maladie grave chez les humains. Il a été la cause de plusieurs éclosions de maladies d’origine alimentaire au cours des dernières années. y compris une éclosion aux États-Unis en 2019. lié à live dindes et produits crus de dinde qui ont entraîné 358 maladies, 133 hospitalisations et un décès.
Selon l’étude, Salmonella enterica peuvent exister chez les animaux destinés à l’alimentation sous forme de populations multisérovares (groupes multiples de micro-organismes étroitement apparentés), et différents sérotypes peuvent abriter divers profils de RAM. conventionnel salmonelle l’isolement n’évalue la MGR que dans les membres les plus abondants d’une population multisérovare, ce qui reflète généralement leur abondance relative dans l’échantillon initial.
La RAM dans les sérovars sous-jacents est un réservoir non détecté qui peut facilement être élargi lors de l’utilisation d’antimicrobiens, selon le rapport.
Dans l’étude, le profilage CRISPR-SeroSeq a démontré que 60 pour cent des échantillons de matières fécales de bovins abritaient plusieurs sérovars, y compris de faibles niveaux de salmonelle Lecture dans 11 pour cent des échantillons, qui n’ont pas été trouvés par culture salmonelle tests d’isolement.
Les résultats de l’étude ont des implications pour le traitement des animaux destinés à l’alimentation malades et des personnes infectées par la consommation de viande contaminée.
« Cela suggère que les tests traditionnels ont sous-estimé la quantité de bactéries résistantes aux antibiotiques dans le passé », a déclaré Shariat. « Nous devons connaître les profils de résistance aux antimicrobiens des bactéries présentes chez les animaux. Cette connaissance pourrait nous faire changer notre choix du type d’antibiotique que nous utilisons pour traiter les animaux malades. Il peut également nous aider à choisir le meilleur antibiotique pour les personnes qui tombent malades en mangeant de la viande contaminée.
L’étude complète peut être consultée en une partie ici.
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