Ce mois-ci, la Food and Drug Administration des États-Unis a publié une étude sur l’efficacité du GenomeTrakr Whole Genome Sequencing (WGS) Network, un outil scientifique qui aide la FDA à détecter, enquêter et limiter la propagation des épidémies de maladies d’origine alimentaire.
En 2019, on estimait déjà que le programme fournissait près de 500 millions de dollars en prestations de santé annuelles, comparativement à un investissement d’environ 22 millions de dollars des organismes de santé publique.
La FDA a créé le réseau WGS en 2013, comme un outil pour améliorer la sécurité alimentaire. Le réseau s’est développé pour inclure des laboratoires fédéraux, étatiques, hospitaliers et autres aux États-Unis et dans d’autres pays qui utilisent WGS pour l’identification des agents pathogènes.
L’étude de la FDA présente une analyse de la mise en œuvre du suivi des sources du génome entier sur la contamination potentielle des aliments et les maladies connexes par le biais d’analyses théoriques, empiriques et coûts-avantages. Plus précisément, l’étude a examiné les épidémies de produits alimentaires réglementés par la FDA de 1999 à 2019 et a examiné l’effet du programme de détection des agents pathogènes du National Center for Biotechnology Information (NCBI).
Les résultats de l’étude suggèrent également que chaque 1 000 isolats de WGS supplémentaires ajoutés à la base de données publique du NCBI est associé à une réduction d’environ 6 maladies par agent pathogène du WGS, par an.
Même selon des hypothèses prudentes, le programme a probablement atteint le seuil de la même chose au cours de sa deuxième année de mise en œuvre et pourrait produire des avantages croissants pour la santé publique à mesure que le réseau GenomeTrakr mûrit, selon les responsables.
Actuellement, la FDA continue de faciliter les opportunités d’accélérer l’adoption du WGS par les laboratoires publics et privés. Le WGS et le GenomeTrakr ont également un rôle à faire progresser les objectifs énoncés dans le plan directeur de la FDA pour la sécurité alimentaire plus intelligente, qui comprennent la facilitation des possibilités d’accélérer le séquençage des agents pathogènes.
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