Les chercheurs seront en mesure de capitaliser sur les données pour faire des progrès dans la compréhension génétique et la prévention ultime des maladies du bétail qui n’ont pas été réalisables avec de plus petits ensembles de données.
En réponse aux tendances des consommateurs qui se dirigent vers l’agriculture animale sans antibiotiques, l’Université du Maryland (UMD) a récemment reçu une subvention du Department of Agriculture National Institute of Food and Agriculture des États-Unis (USDA-NIFA) pour analyser des millions de documents conservés par le Council on Dairy Cattle Breeding (CDCB) dans le but d’identifier les gènes et les mécanismes sous-jacents de la résistance aux maladies chez les bovins laitiers.
« Grâce à ce projet, nous générons des connaissances sur les gènes liés à la mammite et à d’autres maladies du bétail laitier, ainsi qu’à fournir un modèle qui prédit quels animaux sont les plus résistants à la maladie », a déclaré Li Ma, professeure agrégée en sciences animales et aviaires à l’UMD et chercheuse principale sur cette subvention.
« Si nous pouvons utiliser ce grand ensemble de données pour extraire des traits de santé et identifier les gènes liés à la résistance aux maladies, lorsqu’un producteur choisit un père ou une vache pour la reproduction, il peut utiliser des informations sur la santé et pas seulement se concentrer sur la production et le rendement du lait. Cela peut créer des animaux qui ne sont pas seulement des producteurs élevés, mais aussi résistants aux maladies.
« Le risque de maladie a également augmenté dans le même temps, cependant, » a dit Ma. « C’est pourquoi nous essayons maintenant de mettre davantage l’accent sur la résistance aux maladies avec une approche similaire, en utilisant la sélection combinée avec des données génétiques ou génétiques pour essayer d’améliorer la résistance aux maladies avec des données déjà recueillies auprès de l’industrie laitière.
« Cette grande base de données tenue par le CDCB est une base de données financée par l’industrie où elle télécharge des données sur le rendement, la reproduction, les dossiers de la vache, tout ce qui est important pour la valeur de cette vache. Ils envoient un échantillon d’ADN pour avoir une idée de la valeur de la vache, et tous ces dossiers – plus de deux millions de vaches et des dizaines de millions de dossiers de performance – sont conservés dans cette base de données de l’industrie. Les données sont déjà générées par l’industrie et sont assises là en attente d’analyse. Maintenant que les données sont disponibles, nous pouvons faire plus de recherche et d’application pour l’industrie et pour le bien-être des animaux.
Le projet vise également à bénéficier directement à l’industrie laitière et au bien-être de leurs bovins, a expliqué Ma, car il aidera les producteurs à sélectionner les animaux les plus résistants aux maladies.
« Les gens peuvent également faire quelques études fonctionnelles en biologie moléculaire, et cette information aidera à stimuler la recherche future. Par exemple, s’il y a une grande cible génétique identifiée dans ce projet, les chercheurs peuvent utiliser l’édition du génome pour aider à guérir ou corriger la maladie en question, et éclairer les futures méthodes de recherche ou les pratiques de reproduction. Une meilleure compréhension de la maladie elle-même et de ses mécanismes sous-jacents est toujours importante dans la lutte contre la maladie à long terme.
