Les infections à Campylobacter, Salmonella et E. coli ont diminué en Europe, mais les infections à Listeria monocytogenes ont augmenté en 2019, selon les chiffres du rapport zoonoses.
La campylobactériose était la meilleure infection suivie de salmonellose, d’E. coli productrice de toxines shiga (STEC), de yersiniose et de listériose, selon le rapport annuel de l’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC). Pour obtenir des données sur les flambées épidémiques en Europe en 2019, cliquez ici.
L’EFSA et l’ECDC ont été informés de l’incomplétivité de certaines données par quelques États membres en raison de la pandémie covid-19. Cela a eu une incidence sur les ressources allouées aux zoonoses et à la collecte de données d’origine alimentaire, ce qui a retardé les rapports des niveaux régional et national.
En 2019, la campylobactériose était la zoonose la plus fréquemment signalée, comme elle l’a été depuis 2005, représentant 50 % de toutes les infections. Le nombre de cas confirmés était de 220 682, ce qui est une diminution par rapport aux 246 571 cas de 2018. Près de 20 500 personnes avaient besoin de soins hospitaliers et 47 sont décédées en 2019.
C’est en République tchèque, en Slovaquie, au Danemark et au Royaume-Uni que le nombre de signalements a été le plus élevé. Les plus bas se trouvaient en Bulgarie, à Chypre, en Grèce, en Lettonie, en Pologne, au Portugal et en Roumanie. La Turquie, la Thaïlande et le Maroc étaient les principaux pays probables d’infection en dehors de l’UE.
Sept États membres ont communiqué les résultats d’échantillons de contrôle officiels prélevés dans le cadre de la limite réglementaire campylobacter pour les entreprises alimentaires. Sur les 3 346 échantillons de peau de cou prélevés sur des carcasses de poulets de grillage réfrigérés, 1 365 étaient positifs et 506 dépassaient 1 000 unités de formation de colonies par gramme (CFU/g).
Sept pays ont communiqué ces données sur la base des résultats d’échantillonnage des entreprises alimentaires. Sur les 15 323 échantillons de peau du cou, 2 038 ont donné un résultat positif et 1 033 ont dépassé la limite de 1 000 CFU/g.
Salmonella Mikawasima hausse
La salmonellose était la deuxième infection gastro-intestinale la plus courante avec 87 923 patients confirmés signalés, ce qui est en baisse par rapport aux 91 858 en 2018. Au total, 140 décès ont été signalés, dont 46 ont été enregistrés par le Royaume-Uni.
Les taux de notification les plus élevés ont été signalés par la République tchèque et la Slovaquie, tandis que les plus faibles provenaient de Chypre, de Grèce, d’Irlande, d’Italie, du Portugal et de Roumanie. La Turquie, l’Égypte, la Thaïlande et l’Inde étaient les endroits où les infections associées aux voyages étaient les plus fréquentes en dehors de l’Europe. Dans l’UE, l’Espagne et la Grèce étaient les principales destinations liées à la maladie.
Les principaux séromanes salmonella étaient Enteritidis, Typhimurium, typhimurium monophasique (1,4,[5],12:i:-) et Infantis. Salmonella Mikawasima a augmenté de 92,1 % et de 137,1 % par rapport à 2018 et 2017, respectivement, et s’est inscrite dans le top 20 en 2019, en remplacement du Brandebourg.
Les préparations pour nourrissons avaient 123 salmonelles positives pour les produits prêts-à-manger (RTE) et 562 pour les produits autres que RTE. Ces résultats méritent d’être pris en compte parce que ce produit est destiné aux jeunes enfants sensibles et que des flambées passées ont été enregistrées, selon le rapport.
Listeria mortelle et évolution des tendances du STEC
En 2019, 2 621 cas invasifs confirmés de listériose ont été enregistrés contre 2 545 en 2018. Le nombre de cas mortels dans l’UE a été élevé et a augmenté par rapport à 2018 et 2017.
Les taux de déclaration les plus élevés ont été en Estonie, en Suède, au Danemark et à Malte, tandis que les plus faibles se trouvaient en Bulgarie, en Croatie, à Chypre et en Roumanie.
La listériose a eu la plus forte proportion de cas hospitalisés de tous les zoonoses sous surveillance de l’UE et 300 personnes sont mortes. La France a eu le plus de cas mortels avec 56, suivie par 55 en Espagne et 54 en Pologne.
En 2019, 7 775 cas confirmés d’infections à E. coli (STEC) productrices de toxines shiga ont été signalés, ce qui est en baisse par rapport à 8 161 en 2018.
Les taux de notification les plus élevés ont été en Irlande, à Malte, au Danemark et en Suède, tandis que la Bulgarie, Chypre, la Grèce, la Lituanie, la Pologne, le Portugal et la Slovaquie ont eu des chiffres faibles. L’Égypte a été le plus souvent répertoriée comme le pays probable d’infection des cas liés aux voyages, suivie de la Turquie, de l’Espagne, du Maroc, de l’Italie et de la Thaïlande.
Les 394 cas de syndrome hémolytique urémique (SHU) étaient à peu près au même niveau qu’en 2018. Le sérogroupe O26 était le plus fréquent parmi les cas de SHU au lieu d’O157, comme c’est le cas depuis 2016.
En 2019, 10 décès dus aux infections à STEC ont été signalés contre 11 en 2018. La moitié des décès étaient associés au SHU. Les sérogroupes liés aux décès étaient O157, O145 et O8.
Le sérogroupe le plus courant était o157, mais sa proportion a diminué depuis 2012. E. coli O26 a terminé deuxième, suivi de O146, O103, O91, O145 et O128. Trois nouveaux sérogroupes – O27, O78 et O182 – ont été ajoutés à la liste des 20 premiers en 2019 en remplacement d’O5, O55 et O174.
Les personnes les plus touchées par le STEC étaient les nourrissons et les enfants jusqu’à l’âge de 4 ans, qui représentaient les deux tiers des cas de SHU. Cependant, la plupart des décès étaient chez des personnes âgées de plus de 25 ans.
Yersinia, Brucella et Trichinella
La yersiniose était la quatrième zoonose la plus courante avec 6 961 patients confirmés dans l’UE. Près de 650 personnes avaient besoin d’un traitement hospitalier et deux sont décédées.
L’Allemagne a eu le plus de patients avec la France en deuxième. La Finlande a eu le taux le plus élevé, suivie de la Lituanie et de la République tchèque. Les nourrissons et les enfants jusqu’à l’âge de 4 ans représentaient près du quart de tous les patients confirmés.
En 2019, 310 cas confirmés de brucellose ont été signalés avec 98 personnes ayant besoin d’un traitement hospitalier et deux décès contre 358 infections en 2018. Le nombre de cas confirmés était au plus bas niveau depuis le début de la surveillance au niveau de l’UE en 2007.
Les taux de déclaration les plus élevés ont été en Grèce et au Portugal. Parmi les cas liés aux voyages, la plupart se sont rendus en Irak, en Turquie, en Bosnie-Herzégovine et en Égypte. Dans l’UE, trois personnes ont déclaré avoir voyagé en Espagne et une personne s’était rendu en Roumanie pendant la période d’incubation.
Une flambée de brucella melitensis à partir de fromage de chèvre frais fait maison a été signalée dans le nord du Portugal entre 2018 et 2019. Cette flambée s’ajoute à la préoccupation du commerce illégal du fromage au lait cru et à la remise en cause des normes de sécurité alimentaire dans l’UE, selon le rapport. Une autre flambée a été notée par l’Autriche. Il était lié au lait non pasteurisé consommé en Turquie.
En 2019, 96 cas confirmés de trichinellose ont été signalés dans l’UE, contre 66 l’année précédente. Cette augmentation est principalement attribuable à une hausse en Bulgarie, en Italie et en Espagne. Six personnes ont été hospitalisées et une est décédée. La principale raison de cette hausse est la consommation plus élevée de produits du porc faits maison pendant l’hiver et la saison de chasse au sanglier, selon le rapport.
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