Une nouvelle installation cherche à sauvegarder d’importantes recherches sur les microbiomes agricoles et à permettre la production durable de six grandes cultures vivrières au Royaume-Uni.
La collection culturelle de CABI où se tiendront les microbiomes des principales cultures du Royaume-Uni
Une équipe de scientifiques met en œuvre des techniques de recherche de cyro dans le but de préserver d’importants échantillons de microbiomes de cultures provenant de divers sols du Royaume-Uni.
Pour faciliter ce projet, certains des plus grands instituts de recherche agricole du Royaume-Uni ont uni leurs forces pour développer la Crop Microbiome Cyrobank (UK-CMCB). Cela fournira à l’équipe un endroit pour s’approvisionner en données et en échantillons pour leurs travaux, y compris les matériaux microbiens vivants, et le séquençage génomique et métagénomique (ADN) de différents environnements de microbiome tels que le rhizoplane.
« En préservant ces précieux échantillons microbiens de cultures, à partir d’un « instantané unique dans le temps », nous générerons une ressource représentative, très précieuse et unique à partir de systèmes de culture clés du Royaume-Uni qui deviendront une ressource vitale pour les chercheurs scientifiques pour les générations à venir », a expliqué le Dr Matthew Ryan, conservateur, Collection des ressources génétiques à l’ABI.
« Nous utiliserons la cryotechnologie développée au Royaume-Uni qui utilise de l’azote liquide pour assurer la sécurité des échantillons à des températures très froides. Si vous le souhaitez, il s’agit d’une « arche de Noé » de microbes britanniques provenant de systèmes de culture et qui a de nombreuses utilisations passionnantes potentielles.
Toutes les ressources du projet seront entièrement caractérisées à l’aide de techniques avancées de séquençage de l’ADN afin que les scientifiques puissent découvrir quels microbes sont présents, ce qu’ils font dans le microbiome et quel rôle ils jouent dans l’amélioration de la croissance des cultures. Le UK-CMCB créera ensuite une base de données organisée d’exemples d’informations associées à des séquences annotées, des méta-données et des outils d’analyse pour les utilisateurs finaux.
« La santé des sols est particulièrement importante », a déclaré le Dr Tim Mauchline, microbiologiste des plantes et des sols à Rothamsted Research. « Si nous pouvons mieux comprendre la fonction des microbes présents dans nos sols, nous pouvons utiliser ces informations pour aider les agriculteurs à produire des cultures durables. Il est clairement nécessaire d’accroître la production alimentaire et de réduire notre dépendance aux engrais chimiques et aux pesticides. Il est impératif que des solutions biologiques soient trouvées pour assurer la sécurité alimentaire du Royaume-Uni.
