Les données sur l’apparition de la résistance aux antimicrobiens dans les infections humaines de Salmonella et Campylobacter en Europe ont révélé peu de progrès.
Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et l’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) ont constaté que la résistance est encore élevée chez les bactéries qui causent des infections d’origine alimentaire.
Les données de 2018 et 2019 sur la résistance aux antimicrobiens (AMR) chez les bactéries zoonotiques et indicielles provenant d’humains, d’animaux et d’aliments sont collectées chaque année par les États membres de l’UE et analysées par l’EFSA et l’ECDC.
Le suivi 2018 s’est concentré sur la volaille et les carcasses et viandes dérivées, alors qu’en 2019 l’objectif était les porcs et les veaux de moins d’un an, et leur viande.
La déclaration de l’AMR comprenait des données sur salmonella, Campylobacter et les isolats d’E. coli indicateurs, ainsi que de la surveillance des isolats présumés d’ESBL‐/AmpC‐/carbapenemase‐producing E. coli.
Salmonella et Campylobacter
Chez l’homme, une forte résistance à la ciprofloxacine, un antibiotique couramment utilisé pour traiter plusieurs types d’infections, a été signalée chez Salmonella Kentucky. Ces dernières années, Salmonella Enteritidis résistant à l’acide nalidixique et/ou à la ciprofloxacine a été de plus en plus signalée dans plusieurs pays.
L’apparition croissante de la résistance à la fluoroquinolone et au quinolone dans ces types de Salmonella reflète probablement la propagation de souches particulièrement résistantes, selon les experts.
Chez Salmonella spp. des cas humains en 2019, la résistance à l’ampicilline, aux sulfonamides et aux tétracyclines était à des niveaux globalement élevés, tandis que la résistance aux céphalosporines de troisième génération était faible à 1,8 % et 1,2 % pour le céfotaxime et le céftazidime, respectivement.
Seuls huit pays ont testé une résistance aux antimicrobiens de dernière ligne azithromycine et tigecycline, mais la résistance était faible chez salmonella spp. à environ 1 pour cent.
Pour Campylobacter, la résistance à la ciprofloxacine est si fréquente dans la plupart des pays que cet antimicrobien est d’une utilité limitée dans le traitement de ces infections chez l’homme.
La proportion d’isolats humains de Campylobacter jejuni résistants à l’érythromycine était faible à 1,5 pour cent, mais plus élevée chez Campylobacter coli à 12,9 pour cent.
Des proportions élevées de résistance à la tétracycline ont été observées chez Campylobacter jejuni et coli. Les pays ont signalé de faibles niveaux de résistance à la gentamicine, à l’exception de l’Italie pour Campylobacter coli.
Résistance et tendances multiples au fil du temps
La résistance combinée à deux antimicrobiens d’une importance critique — les fluoroquinolones et les céphalosporines de troisième génération chez Salmonella et les fluoroquinolones et les macrolides à Campylobacter — demeure faible. Ces antimicrobiens sont couramment utilisés pour traiter les infections graves de Salmonella et Campylobacter chez l’homme.
La résistance aux médicaments multiples (DMR) était élevée dans l’ensemble, soit 25,4 p. 100 chez les salmonelles provenant de cas humains. Il a été le plus fréquemment rapporté parmi salmonella typhimurium monophasique 1,4,[5],12:i:- et Salmonella Kentucky à environ 73 pour cent. Onze isolats étaient résistants à huit des neuf substances testées, seulement sensibles au meropenem.
Le MDR dans les isolats testés pour quatre classes d’antimicrobiens — fluoroquinolones, macrolides, tétracyclines et aminoglycosides — était globalement faible à Campylobacter jejuni mais modéré chez Campylobacter coli. Le plus commun était résistance à la ciprofloxacine et à la tétracycline.
De 2015 à 2019, une baisse de la résistance à l’ampicilline et aux tétracyclines a été observée chez les isolats de Salmonella chez l’homme dans huit et onze États membres respectivement. Les tendances croissantes de la résistance étaient plus fréquentes que les diminutions de la ciprofloxacine/quinolones et de la tétracycline chez Salmonella Enteritidis et de l’ampicilline chez Salmonella Infantis.
Des tendances croissantes de résistance à la fluoroquinolone ont été observées à Campylobacter jejuni dans neuf pays et à Campylobacter coli dans deux. Dans l’ensemble, la résistance à la tétracycline a augmenté, mais la résistance à l’érythromycine a diminué.
Une tendance à la baisse a également été observée dans la prévalence de la bêta-lactamase à spectre étendu (ESBL) – produisant E. coli dans des échantillons d’animaux producteurs d’aliments de 13 pays entre 2015 et 2019. Ceci est important car des souches particulières d’E. coli productrice d’ESBL sont responsables d’infections graves chez l’homme, selon les experts.
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