Les rapports de laboratoire sur les norovirus en Angleterre ont été plus touchés que Campylobacter par la pandémie de COVID-19, selon une étude.

Les chercheurs ont étudié le lien entre la déclaration en laboratoire des deux agents pathogènes, le nombre de tests de dépistage du coronavirus et les mesures de prévention et de contrôle des infections pendant la pandémie.

En Angleterre, les rapports de laboratoire du norovirus et de Campylobacter sont enregistrés via un système de surveillance national, mais seul Campylobacter est une maladie à déclaration obligatoire. La campylobactériose est généralement liée à la consommation d’aliments insuffisamment cuits et à la contamination croisée pendant la préparation. Le norovirus est principalement associé à la transmission de personne à personne et aux éclosions dues à des produits contaminés ou à des manipulateurs d’aliments infectés.

Les deux agents pathogènes affichent des tendances saisonnières annuelles avec une activité norovirus probablement directement liée à des facteurs météorologiques tels que la température, tandis que l’infection à Campylobacter est indirectement influencée par des changements de comportement humain liés aux conditions météorologiques.

Impact plus important sur les norovirus
Les totaux des rapports de laboratoire hebdomadaires pour les norovirus et Campylobacter entre la fin de juin 2015 et la fin octobre 2020 ont été tirés du système national de surveillance des rapports de laboratoire avec des résultats rapportés dans la revue PLOS One.

Les données sur les tests de dépistage du virus qui cause la COVID-19, appelé SARS-CoV-2, en Angleterre dans les laboratoires de diagnostic ont été utilisées pour indiquer la pression sur les services de test et la capacité d’effectuer des activités régulières.

À partir de mars 2020, une réduction du nombre de rapports de laboratoire sur les norovirus et Campylobacter a été observée, mais l’impact sur le norovirus a été plus prononcé. Les rapports de laboratoire de Campylobacter se sont rétablis, mais ceux du norovirus sont restés faibles.

La réduction des rapports de norovirus était significativement associée à la période suivant le premier décès de COVID-19 au Royaume-Uni au début du mois de mars. Les résultats des modèles Campylobacter étaient similaires.

Le norovirus a été davantage touché au cours des premiers mois de la pandémie. L’effet de la rigueur des mesures de lutte contre la COVID-19 a été plus important pour les rapports des laboratoires de norovirus que pour Campylobacter. Les changements dans la capacité de dépistage semblent avoir eu une incidence plus négative sur la déclaration des norovirus.

La réduction totale estimée était de 47% à 79% pour les norovirus de mars à octobre 2020. La réduction pour Campylobacter est passée de 19% à 33% en avril à 1% à 7% en août.

Facteurs à l’origine du déclin
La baisse des rapports de laboratoire sur les norovirus a été significativement associée à des changements dans les politiques de contrôle des infections et les approches de dépistage du virus SARS-CoV-2.

Les tests de laboratoire pour le norovirus ont probablement été plus touchés pendant la pandémie que ceux de Campylobacter en raison de la capacité d’obtenir des échantillons pour la confirmation en laboratoire et la priorité des tests.

En raison des similitudes entre le norovirus et le coronavirus, il est probable qu’il y ait eu une véritable réduction des norovirus résultant des mesures de contrôle des infections introduites pour COVID-19, telles qu’un plus grand lavage des mains, une distanciation sociale et une meilleure hygiène dans les maisons de soins et autres établissements de soins de santé.

Pour Campylobacter, les fermetures de restaurants en raison de l’épidémie auraient pu réduire la transmission de l’infection, mais il y avait une augmentation de la préparation des aliments à la maison.

Un autre facteur a été un changement dans le comportement de recherche de soins de santé pendant la pandémie, car le norovirus et Campylobacter diffèrent par la gravité clinique et la durée de la maladie. Les patients atteints d’une infection à Campylobacter peuvent avoir été plus susceptibles de contacter des fournisseurs de soins de santé et de faire prélever un échantillon pour le diagnostic en laboratoire et la confirmation de l’agent pathogène.

Les scientifiques n’ont pas pu estimer la proportion de l’impact attribuée à des facteurs tels qu’une réduction réelle de la transmission et des changements dans le comportement de recherche de soins de santé.

Les chercheurs ont déclaré que l’étude souligne les différents impacts qu’une pandémie peut avoir sur la surveillance des maladies infectieuses gastro-intestinales et sur la façon dont les efforts pour contrôler une chose peuvent affecter d’autres.

« Cela ajoute à la nécessité d’inclure la préparation en cas de pandémie pour inclure la prise en compte du maintien des systèmes de surveillance de routine prioritaires et des ressources nécessaires pour analyser les données de surveillance pendant la période pandémique. Les effets directs et indirects de la pandémie pourraient, en altérant les fonctions de surveillance essentielles, entraver la capacité de détecter les menaces continues pour la santé publique nationale ou internationale.

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